Metataxonómica

El Servicio de Metataxonómica ofrece un análisis completo de la diversidad biológica en diferentes tipos de muestras, ya sean ambientales o biológicas. Este servicio se basa en la secuenciación de regiones específicas del ADN, conocidas como «códigos de barras» o «barcodes», que permiten identificar y cuantificar las especies presentes en una muestra determinada. El proceso está optimizado para la identificación de procariotas, con el marcador 16S; la identificación de hongos, con el marcador ITS; y la identificación de eucariotas, con el marcador 18S.

El servicio engloba una inspección de la calidad de los datos de secuenciación brutos con un preprocesamiento para eliminar artefactos y mejorar la calidad de las secuencias. Posteriormente se aplican distintos algoritmos para la reconstrucción de los genes marcadores y su asignación taxonómica empleando distintas bases de datos biológicas de referencia como: GenBank o SILVA, lo que permite identificar las especies presentes en la muestra y estimar su abundancia relativa.