Análisis transcriptómico

El servicio de RNA-Seq ofrece la posibilidad de estudiar la expresión génica mediante la cuantificación de la abundancia de moléculas de ARN en una muestra a partir de una referencia conocida, y su comparación en distintas condiciones biológicas.

Se trata de un proceso que comienza con la inspección de la calidad y preprocesamiento de las lecturas de secuenciación. Posteriormente se alinean las lecturas útiles a una referencia determinada. Con la cuantificación del alineamiento se obtienen los datos de expresión de cada gen. A esta matriz de cuantificación de le aplica distintos algoritmos para calcular la expresión diferencial entre las distintas condiciones experimentales del estudio. Finalmente, se procede a un estudio funcional de los genes diferencialmente expresados.