Metagenómica por Shotgun
El Servicio de Metagenómica por Shotgun permite el estudio de la diversidad genética y funcional de comunidades microbianas complejas presentes en muestras ambientales o biológicas. La Metagenómica por Shotgun implica la secuenciación del total del ADN de una muestra. Este enfoque proporciona una visión completa de todos los genes presentes, incluidos aquellos microorganismos desconocidos o no cultivables.
El análisis bioinformático de los datos de Metagenómica por Shotgun es un proceso complejo que consta de varias etapas, comenzando con la inspección de la calidad y preprocesamiento de las lecturas de secuenciación. Posteriormente se procede a la reconstrucción de los genomas aplicando distintos algoritmos. Una vez reconstruidos se realiza la anotación de los genes y la identificación de sus funciones. Esta etapa nos permite realizar un análisis de diversidad biológica y funcional de la muestra, así como de su composición taxonómica.