SustainPineDB

Assembly Name: SustainPine v3.0

UniGene Name: sp_v3.0_unigene17346

Length: 2469 nt

UniGene Fasta

>sp_v3.0_unigene17346
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Ace file of the UniGene sp_v3.0_unigene17346

Annotations

Source	Descriptions	Term	Type	e value	Identity
AutoFact	Pyruvate kinase n=4 Tax=Picea sitchensis RepID=B8LM06_PICSI	-	-	0.0	94%
FL-Next	sp=Pyruvate kinase; Picea sitchensis (Sitka spruce) (Pinus sitchensis).	-	-	0.0	94%

Source	ECs	Term	Type	e value	Identity
Sma3		EC:2.7.1.4-	-	0.0	-

Source	InterPros	Term	Type	Identity
Sma3	Pyruvate kinase	IPR001697	-	-
Sma3	Pyruvate/Phosphoenolpyruvate kinase	IPR015813	-	-
Sma3	Pyruvate kinase, alpha/beta	IPR015794	-	-
Sma3	Pyruvate kinase, barrel	IPR015793	-	-

Source	Species	ID	Description	Identity
ATG	Arabidoptis thaliana	AT5G52920.1	PKP1, PKP-BETA1, PKP2 plastidic pyruvate kinase beta subunit 1 chr5:21463680-21466612 FORWARD LENGTH=579	72%
RefSeq	Arabidopsis thaliana	NP_200104.1	pyruvate kinase [Arabidopsis thaliana]	72%
RefSeq	Populus trichocarpa	XP_002317739.1	predicted protein [Populus trichocarpa]	71%

Full-Lengther Next Prediction

Fln status: Complete

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Fln subject: B8LM06

Fln msg:

Fln protein: MAQTVMSGSRLCSSTQTCAIQKNNSVQEQLGSSRLLCGRIQVFQRRKVEQERLQQTGFSVRATSLRTQRVPRPGHGIFPASLQGLVEDGKDSFTLEEGLQAEEKSAGIWTKPSVQRKTKIVCTIGPSTSTPEMIHKLAEEGMNVARLNMSHGDHASHKKVIDLVKEYNAKSADNVIAIMLDTKGPEVRSGDLPQPIMLGKGQEFIFTIKRGVGSEKCVSVNYDDFVNDVEKGDTLLVDGGMMSLVVKSKTSDSVICEVIDGGELKSRRHLNVRGKSATLPSITDKDWEDIKFGVENEVDFYAVSFVKDAKVVHELKDYLKSCNSDIQVTVKIESADSIPNLHSIISASDGAMVARGDLGAELPIEEVPLLQEDIIRVCRSMGKPVIVATNMLESMINHPTPTRAEVSDIAIAVREGADAVMLSGETAHGKYPLKAVKVMHTVALRTEATMLDDEPPASFGPTSKEHMSEMFAFHATMMSNTLGTSIVVFTRTGFMATLLSHYRPFGTIFAFTNQERVKQRLALFRGIRPIYMPFSNDAEETFSNALSLLQKLGMLKEGEQVALVQSGRQPIWRSESTHHIQVRTVQDCTPTK*

Protein Length: 594

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Fln Alignment:

Contig17346___MAQTVMSGSRLCSSTQTCAIQKNNSVQEQLGSSRLLCGRIQVFQRRKVEQERLQQTGFSVRATSLRTQRVPRPGHGIFPASLQGLVEDGKDSFTLEEGLQAEEKSAGIWTKPSVQRKTKIVCTIGPSTSTPEMIHKLAEEGMNVARLNMSHGDHASHKKVIDLVKEYNAKSADNVIAIMLDTKGPEVRSGDLPQPIMLGKGQEFIFTIKRGVGSEKCVSVNYDDFVNDVEKGDTLLVDGGMMSLVVKSKTSDSVICEVIDGGELKSRRHLNVRGKSATLPSITDKDWEDIKFGVENEVDFYAVSFVKDAKVVHELKDYLKSCNSDIQVTVKIESADSIPNLHSIISASDGAMVARGDLGAELPIEEVPLLQEDIIRVCRSMGKPVIVATNMLESMINHPTPTRAEVSDIAIAVREGADAVMLSGETAHGKYPLKAVKVMHTVALRTEATMLDDEPPASFGPTSKEHMSEMFAFHATMMSNTLGTSIVVFTRTGFMATLLSHYRPFGTIFAFTNQERVKQRLALFRGIRPIYMPFSNDAEETFSNALSLLQKLGMLKEGEQVALVQSGRQPIWRSESTHHIQVRTVQDCTPTK
B8LM06_______________MAQAVMSGSRLCSSMQTCAAQKKNSVQEQLSSSRLLCGRIRFFQRRKVEQEWPQQSGFPIHATSLRTKRVPRPGYEVFPASPEGLVEDWKDSFTREEGLQAEEKSAGIWTKTSVQRKTKIVCTIGPSTSTPEMIHKLAEEGMNVARLNMSHGDHASHKKVIDLVKEYNAQSADNVIAIMLDTKGPEVRSGDLPQPIMLGKGQEFIFTIKRGVGSEKCVSVNYDGFVNDVEKGDTLLVDGGMMSLTVKSKTSDSVICEVIDGGELKSRRHLNVRGKSATLPSITDKDWEDIKFGVENEVDFYAVSFVKDAKVVHELKDYLKSCNSDIQVTVKIESADSIPNLHSIISASDGAMVARGDLGAELPIEEVPLLQEDIIRVCCSMGKPVIVATNMLESMINHPTPTRAEVSDIAIAVREGADAVMLSGETAHGKYPLKAVKVMHTVALRTEATMLDEEPPASFGRTSKEHMSEMFAFHATMMSNTLGTSIVVFTRTGFMATLLSHYRPFGTIFAFTNEERVKQRLALYRGIRPIYMPFSNDAEETFSKALSLLQKLGMLKEGEQVALVQSGRQPIWRSESTHHIQVRTVQDCTPTK

SNPs (tot: 1)

Position	A %	C %	G %	T %	Probability
1518	3			96	0.991825

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Biología Molecular y Biotecnología de Plantas, Facultad de Ciencias y Plataforma Andaluza de Bioinformática, Universidad de Málaga, E-29071 Málaga, Spain